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27 diciembre 2012

Biocatálisis

(Vía)
El nacimiento de la bioquímica moderna,  los trabajos del químico alemán Emil Fischer (1852-1919). Entre sus numerosas contribuciones se encuentran las de 1902 (ups, me he pasado de siglo): demostró la composición amino-ácida de las proteínas y formuló la hipótesis del enlace peptídico, a la que también llegaba independientemente, ese mismo año, Hofmeister. Pero lo que nos interesa para este post, son sus estudios sobre la forma de acción de las enzimas -el término enzima lo había introducido el fisiólogo alemán Kühne en 1878. Fischer concluía que la acción de una enzima era específica en relación con un sustrato: la enzima era al sustrato como la llave a la cerradura. Fischer recibió el Premio Nobel de Química en 1902.

Ya hablamos en otra ocasión sobre las enzimas. Uno de los aspectos más interesantes (al menos para un químico) es que Emil Fischer se equivocó: existe la llamada promiscuidad catalítica, de manera que podemos forzar a la enzima para que actúe sobre un sustrato diferente al natural. Mediante la ingeniería genética de proteínas o simplemente cambiando las condiciones del medio de reacción, podemos conseguir el producto que deseamos. La evolución dirigida es la modificación de la secuencia de aminoácidos de una enzima con el fin de obtener un nuevo biocatalizador con mejores propiedades catalíticas.

¿Por qué es tan importante? Todo lo que nos permite vivir como estamos acostumbrado (medicamentos, ropa, tecnología, alimentos, etc.) son productos químicos que provienen (o se conservan) de reacciones químicas. El problema principal de estas reacciones químicas, que pueden ser naturales o artificiales, es que si tengo 20 g de A con 20 g de B, probablemente no obtendré 20 g de C sino bastante menos. Es decir, las reacciones químicas no están acostumbradas al ahorro en tiempo de crisis, requieren una "ayudita" de nosotros los científicos: un catalizador permite que la reacción siga un camino distinto que permita obtener más, y en condiciones menos despilfarradoras (temperaturas más bajas, presión ambiente, más rápido) el producto deseado. Los metales nobles suelen ser excelentes catalizadores químicos, con un algún problema: son caros y contaminan. Así que compensa que busquemos alternativas: veamos si podemos reutilizar el catalizador (cuántas veces nos sirve para repetir la reacción), regenerarlo, cuál es la mínima cantidad que se requiere, o usar enzimas catalíticas o biocatalizadores.

Para conseguir C, la reacción puede no ser un camino recto: A +B pueden darnos X, igual necesito "cambiar" B a B1 antes de hacerlo reaccionar con A. Entonces obtendríamos C1, y deberíamos realizar otra reacción para llegar a C. Es lo que se conoce como reacciones de protección-desprotección.

La biocatálisis es muy interesante desde el punto de vista de la economía atómica: el biocatalizador se regenera; se evitan reacciones de protección-desprotección porque hay más selectividad; las enzimas son biodegradables. La biocatálisis cumple la mayoría de los principios de Química Sostenible, incluso se puede compatibilizar con otras áreas como los fluidos supercríticos y líquidos iónicos, gracias a su versatilidad.



En 1985 se descubrió que las enzimas podían trabajar en disolventes orgánicos, y desde entonces se emplean en síntesis e incluso ha aumentado su aplicabilidad industrial. Es interesante, porque son enzimas estereoselectivas al estar formadas por aminoácidos naturales que son de por sí quirales. 
(Fuente)

Cuando se trabaja en disolventes orgánicos, la enzima mantiene una capa de agua, inapreciable a la vista, necesaria para que realice la reacción, aunque a veces se podría producir una reacción competitiva de hidrólisis con esa capa de agua. En la estructura de una proteína tenemos un balance de residuos hidrofílicos y residuos hidrofóbicos (estos últimos dispuestos hacia el interior---> "lejos" del medio acuoso). Se pensaba que al cambiar el medio de reacción este equilibrio se rompería produciéndose la desnaturalización de la proteína, pero no es así. 

Trabajar en disolvente orgánico tiene sus ventajas: se recupera mejor el producto como consecuencia de que no hacen falta etapas de extracción durante la purificación de este; el disolvente orgánico es un medio hostil para microorganismos y así evitamos la "contaminación microbiana"; al tener un medio orgánico se desactivan la mayoría de residuos hidrofílicos y así disminuyen las reacciones secundarias; no es necesario inmovilizar a la enzima, etc.

En la industria, el uso de enzimas según los tipos es 44% de hidrolasas, 30% de oxidorreductasas, 17% liasas, 6% isomerasas y 3% de transferasas. 

Las hidrolasas, como su nombre indica tienen como función principal es la hidrólisis de ácidos grasos, pero si usamos disolventes orgánicos se pueden producir otras reacciones. Industrialmente se emplean para transesterificación de grasas a partir de triglicéridos, para síntesis de sintones quirales, bien mediante resolución de mezclas o de compuestos polifuncionales. 

Esta entrada participa en la XX edición del Carnaval de Química organizado por @bioamara en el blog La Ciencia de Amara y en la XIX Edición del Carnaval de Biología, organizado por La Fila De Atrás, blog perteneciente a @MyrRB 







16 agosto 2012

Economía basada en biomasa

(Vía)

La biomasa es un término utilizado para designar todos aquellos materiales orgánicos que provienen del mundo animal, vegetal o de los microrganismos. Tiene su importancia porque es la única fuente de materias primas básicas a partir de renovables. El problema de la biomasa para integrarla en nuestra actual economía es que se trata de hidratos de carbono, mientras que tenemos todos los procesos e industrias diseñados para trabajar con hidrocarburos (procedentes del petróleo o del carbón): para poder reciclar toda la infraestructura existente necesitaríamos quitar el oxígeno de la estructura de la biomasa.

¿Por qué interesa una economía basada en materias primas renovables, y por tanto en biomasa? Por un lado, nos permite reforzar la protección del medio ambiente, se puede lograr que exista facilidad de suministro y que este sea seguro y estable. Además, puede fomentar la competitividad y el desarrollo de nuevas tecnologías. Por otro lado, puede ser interesante porque se fomentaría de nuevo la economía rural, aunque hay que tener claro que el objetivo prioritario debe ser la alimentación, es decir: que no se destinen suelo y recursos a cultivos energéticos cuando la población local experimenta hambrunas. Se requiere una gestión con cabeza. Al final, el objetivo principal es lograr un desarrollo sostenible del planeta: que todo el mundo viva bien y que no comprometamos el nivel de vida de generaciones futuras.

En teoría usando biomasa las emisiones de dióxido de carbono a la atmósfera serían nulas (puesto que esa biomasa ha actuado ya como almacén). Personalmente, yo preferiría basar la economía en fuentes que no emitan GEI (gases de efecto invernadero), pero no sé si esto es implementable actualmente.

En términos generales, la biomasa está compuesta por hidratos de carbono, lípidos, proteínas y metabolitos secundarios que mediante transformaciones químicas y/o procesos físicos pueden convertirse en materias primas básicas para la industria química y dar lugar a productos. Es decir, construir bio-refinerías: que son similares  las refinerías de petróleo pero partiendo de biomasa, es decir, de almidón, hemicelulosa, celulosa, lignina, aceite y proteínas. Aunque de momento no se han demostrado sostenibles. 

Un problema asociado al empleo de biomasa es su enorme variedad: puede proceder de actividades agrícolas (forestales o ganaderos), de residuos orgánicos urbanos, de cultivos energéticos. Por eso, para poder aprovechar las "maravillas" de la biomasa, se requieren pre-tratamientos más o menos agresivos para obtener los compuestos que nos interesan (de alguno hicimos un resumen).
(Vía)

Los polisacáridos son principalmente la celulosa, la lignina y el almidón, y se emplean para fabricar polímeros y como combustibles. Tras una hidrólisis de la biomasa, se obtienen hexosas, pentosas y lignocelulosas.

Los lípidos están constituidos por ésteres de glicerina y fosfolípidos, que contienen entre 14 y 20 átomos de carbono y pueden tener dobles enlaces (que se aprovechan para polimerización). Aprovechando su parte polar se pueden fabricar surfactantes (en cristiano, detergentes). También sirven como combustible o para fabricar compuestos químicos.

Las proteínas se caracterizan porque hay una gran variedad, ya que aunque solo existen 12 aminoácidos naturales, estos se combinan de manera aleatoria, lo que hace problemática su polimerización a gran escala. Se usan sobre todo para alimentación animal, o bien se aprovechan las cabezas polares para fabricar adhesivos.

Los metabolitos secundarios representan un grupo importante, no tanto por su cantidad sino por la especificidad: por ejemplo, se obtienen terpenos que sirven como intermedios quirales. La industria biotecnológica se orienta en este campo en el diseño de microorganismos que produzcan un antibiótico en masa, por ejemplo.


Este post participa en el XVII Carnaval de Química alojado en el blog Un geólogo en apuros
http://www.ungeologoenapuros.es/wp-content/uploads/2012/07/carnaval-quimica.jpg
Referencias

Apuntes de la asignatura Materias Primas Renovables, impartida por el profesor Víctor Martínez-Merino y MªJosé Gil (Universidad Pública de Navarra) en el máster de Química Sostenible


Ununcuadio (2012). Economía basada en biomasa Ninguno DOI: 10.1016/S0961-9534(02)00188-5
ResearchBlogging.org

31 marzo 2012

Nanotecnología, en concreto, nanocatalizadores


http://www.cookingideas.es/imagenes/NanoparticulasCancer.jpg
La nanotecnología está de moda. Para los que no han oído nunca esta palabra explicaré qué es un nanómetro… En realidad, creo que bastan nociones de griego para saberlo, en cualquier caso, es 10-9 m 
o al revés un metro son 1000000000 nanómetros. Por lo tanto, es una medida que se usa para medir cosas muy pequeñas. Por ejemplo, una unidad por debajo (el llamado Amstrong) se usa para hablar de distancia de enlace de átomos. Así que las nanopartículas no son átomos pero sí tienen un tamaño parecido a estos.

            ¿Cuál es la ventaja de estas nanopartículas? ¡Muchas! Se están usando en la síntesis de nuevos materiales, porque al ser tienen sus propias propiedades distintas a las que hasta ahora se manejaban en el diseño de nuevos materiales. Se están estudiando como formulaciones para fármacos, de manera que llegue más rápidamente dentro del organismo a dónde debe ejecutar su acción médica, y así evitar los efectos secundarios. También se emplea en el campo de la catálisis (un catalizador es aquella sustancia que permite un camino alternativo de menor energía de manera que la reacción se pueda producir o se produzca más rápidamente) donde tienen características muy interesantes: por ejemplo, en fotocatálisis actúan (al ser tan pequeñas) como moléculas orgánicas cromóforas (que tal como su nombre indica son moléculas que emiten luz al ser irradiadas con una determinada longitud de onda: visible, ultravioleta, infrarrojo, microondas), y en una misma reacción de oxidación-reducción pueden actuar simultáneamente como oxidantes y reductores.

            Emplear nanocatalizadores es interesante en orden a reducir el volumen de residuos generados en un proceso industrial químico. Pero presentan también inconvenientes: por un lado, no es fácil recuperarlos para usarlos de nuevo en otro proceso catalítico (la reciclabilidad es una propiedad importante de cualquier catalizador), son inestables y tienden a formar aglomerados que las desactivan, pero además, ¿su síntesis es sostenible?, ¿está de acuerdo con los principios de la Química Sostenible? Este era el tema de mi trabajo de la asignatura Conceptos Básicos de Química Sostenible.

            Yo he llegado a la conclusión de que no. El método tradicional de obtener nanopartículas metálicas s conseguir la reducción de un metal por medio de agentes químicos (normalmente tóxicos para el hombre y el medio ambiente) o por electroquímica (gasto energético). Además, ya hemos dicho que las nanopartículas son muy inestables, de manera que requieren el uso de estabilizadores (se ha intentado que cada vez sean más inocuos) como polímeros o ligandos que eviten la agregación de las nanopartículas.

            Se están investigando las nanopartículas magnéticas (el metal que interese+ un óxido de hierro magnético), para lograr así recuperar los nanocatalizadores al final de la reacción y poder reutilizarlos. Lo que más me gustó de lo que encontré de mi búsqueda bibliográfica de las nanopartículas es una síntesis empleando como biocatalizador un hongo para conseguir nanopartículas de oro.

            Vamos que es mejorable y estamos mejorando.

14 febrero 2012

Síntesis más verde del Taxol


http://www.carleton.ca/catalyst/2006s/images/taxol.jpg
 El Taxol es un medicamento empleado como anticancerígeno. El principio activo de este medicamento es el paclitaxel, molécula que se encuentra en la corteza de los tejos, y que está aprobada para su uso contra el cáncer de ovario, de mama, lung??, y para el sarcoma de Kaposi relacionado con el SIDA. Este principio activo se aislaba de la corteza del tejo americano, que contenía apenas 0,0004% de paclitaxel.

Esto llevó a una sobreexplotación y deforestación de esta especie, poniendo además en peligro al búho moteado que vivía en esos entornos. Sin embargo, la síntesis en un laboratorio era difícil debido a la complejidad de la molécula que presenta un núcleo tetracíclico con nada menos que 11 centros quirales. La síntesis de paclitaxel requeriría 40 pasos de reacción para obtener un rendimiento final del 2%, lo que naturalmente era inviable. Se propuso una síntesis alternativa que partía de un precursor del paclitaxel (el 10-DAB) que implicaba 11 pasos sintéticos con 7 pasos de aislamiento de intermedios y que generaba grandes residuos de biomasa.
http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/5/59/Taxol.svg/350px-Taxol.svg.png

Finalmente, se ha encontrado una ruta “más verde” en todos los principios de la Química Verde. A partir de las agujas y ramitas del tejo, se obtienen células que producen ellas mismas el paclitaxel. De esta manera, se reducen los residuos, aumenta el rendimiento, se reducen los costes, y se contamina menos.

He querido contar esta historia como ejemplo de que el hombre, cuando se lo propone, tiene cabeza y medios para hacer bien las cosas. Como ponía en las diapositivas de Conceptos básicos de Química Sostenible: “Chemistry is great, and we will make it better”. Es confiar en que el hombre es capaz de solventar los problemas que vayan surgiendo en su desarrollo.

Bibliografía:

Mountford, P., The Taxol Story-Development of a Green Synthesis via Plant Cell Fermentation, Green Chemistry in the Pharmaceutical Industry, 2010 WILEY-VCH

11 febrero 2012

Investigación en ciencia: serendipity


http://3.bp.blogspot.com/_vuAr46C0gxk/SbLIGzonnjI/AAAAAAAANto/qJUosMhOedQ/s400/investigacion.jpg
Se cuentan muchas historias sobre los descubrimientos en ciencia. Fleming descubrió la penicilina porque se le contaminaron las muestras con las que trabajaba; las benzodiacepinas (fármacos que se usan en el tratamiento de la depresión, el insomnio y la ansiedad, entre otros) se descubrieron al hacer limpieza en el laboratorio, se encontraron unos cristales y los mandaron a analizar y resulta que tenían actividad farmacológica. Así, podríamos seguir poniendo muchos ejemplos que podrían venir a decir que los grandes descubrimientos de la ciencia son fruto de la suerte. Mi profesor de Química Farmacéutica, miembro de la IUPAC, lo negaba categóricamente. Él definía este tipo de descubrimientos como serendipity: una mezcla de trabajo, creatividad y suerte.

Suerte a secas no era, porque el investigador podía llevar años tras ese resultado, y de repente, un día lo encuentra casi como por casualidad. ¿Pero se puede hablar de casualidad cuando se está trabajando en ello? Y, sin embargo, sí que hay un componente de casualidad o de suerte o de como lo quieras llamar... La palabra según el profesor Antonio Monge es serendipity.

La investigación es un trabajo donde se mezclan la rigurosidad propia de las ciencias experimentales con la creatividad del propio investigador: hasta dónde es capaz de imaginar, hasta dónde es capaz de ver... Julio Verne en sus novelas habla de inventos que no s ehicieron hasta mucho después. El científico hace algo parecido, aunque quizá no quede tan bonito al ponerlo en un artículo de una revista científica. Es cierto que todo artista aporta un algo a su obra de arte, mientras que el científico se limita a descubrir cómo funciona el universo y cómo puede aprovechar ese funcionamiento para hacer la vida mejor.

Se dice que nadie puede sustituir a un artista, en cambio, a un científico sí. Pero creo que no estoy de acuerdo. Sin quitar nada del mérito que todo buen artista se merece, pienso que el investigador también es artista y que la calidad de sus descubrimientos depende en buena medida de esa dosis de artista o de creatividad. Al fin y al cabo, hay que tener imaginación para postular la teoría de la relatividad, y luego demostrarla con hechos empíricos. Hay que desarrollar la creatividad para diseñar nuevos productos que nos faciliten la vida, sin comprometer la calidad de generaciones futuras. Hay que saber apreciar lo bello para apasionarse con lo que uno hace e invertir horas de largos y repetitivos experimentos que parecen no llevar a ningún lado. Quizá soy demasiado idealista, pero pienso que todos podemos cambiar el mundo. Basta imaginar que es mejor y ponerse manos a la obra cada uno en lo que mejor sepa. Si es ciencia, ciencia, si es arte, arte, si son letras, letras.

03 febrero 2012

Enseñando ciencia


Ya escribí una entrada hablando de educación, de que me parecía que tenemos que cambiar los métodos: enseñar a pensar y enseñar a disfrutar aprendiendo. Hoy quiero hablar de dos proyectos que me parecen grandes aciertos en este sentido.

Del primero me enteré gracias a mi prima que estudia Biotecnología en León. El proyecto se llama Biotechnofarm: Sembrando los Biotecnólogos del Futuro y lleva en vigor desde 2009, en provincias de Valencia, Sevilla, León, Salamanca, Madrid, Zamora y Alicante.Cuenta con financiación del Ministerio de Ciencia e Innovación y la Fundación Española para la Ciencia y la Tecnología. Llevan a cabo talleres de Biotecnología en centros educativos para dar a conocer de manera divulgativa esta rama de la ciencia y a realizar ciertos experimentos como la extracción de ADN de frutas y verduras, diagnóstico forense, ensayos microbiológicos, etc. Se pretende fomentar el autoaprendizaje del alumno, así como en trabajo en equipo y la capacidad crítica tan importante en ciencia. Os dejo aquí los enlaces por si queréis más informaciçon o colaborar económicamente o de otra manera en la difusión del proyecto. 

https://blogger.googleusercontent.com/img/b/R29vZ2xl/AVvXsEh3pl4RkUWM5Ti_9jBt15t5eLBZMbSy9GniVZ5txZe51LQo4BghiRnHznTIiOqCuBjnZggWBnIRA_xu26uvY7uAm9UgkGZwFJM2sj64aFRftDll862zTJ7G79g6C-1lRCSli81_oYrchdEA/s1600/logo%2520biotechnofarm.png
En el segundo proyecto participé yo misma, y se llama Toca la química o también el programa Be a mentor dentro del Año Internacional de la Química 2011. Consistió en que alumnos de grado o de licenciatura de Química volviéramos a nuestros centros educativos como “profesores”. Primero en una charla de diez minutos, cuarto de hora explicábamos por qué era el Año Internacional de la Química, los orígenes de esta ciencia y su desarrollo, así como sus implicaciones en la sociedad actual. Se trataba de transmitir que es una ciencia muy útil y presentar una imagen positiva de progreso y de solución de problemas. Luego pasábamos al laboratorio para hacer experimentos científicos: con la lámpara de Aladino explicábamos las reacciones redox, con el volcán de dicromato la inestabilidad de los reactivos, con el Luminol sus aplicaciones forenses, con el jardín de silicatos la ósmosis, con el Baboplast la síntesis de polímeros. Y realmente conseguíamos presentar la química como algo divertido. Yo me lo pasé en grande...



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